中草藥真空凍干機是凍干機技術應用在中藥干燥加工處理中的真空冷凍干燥機設備，其工作原理是處理好的中藥在凍干機預先冷凍結晶，然后在1~30pa左右的真空環境下直接升華干燥水分，得到含水1%左右的中藥凍干品。主要特點是能保存中藥的原有藥性，方便在常溫下長期保存和攜帶，復水性強，使用方便，容易吸收，不需要再經過熬制或者煎煮。凍干機的中藥凍干技術解決了中藥的存儲、攜帶和使用不方便難題，帶來提供高效率和便利性。
中草藥真空凍干機在得到一個中藥配方后，經過配藥、熬制得到湯劑后，進入SFD中藥凍干機進行低溫冷卻結晶成固態，在結晶溫度-50℃凍結3~5小時左右，然后進入真空干燥的一次干燥階段，一次干燥溫度控制范圍：-50~10℃，凍干機真空控制為：15PA±3，干燥時間為：12~20小時左右。一次干燥結束后，中藥凍干機進入解析干燥階段，控溫范圍：15~55℃，真空冷凍干燥機真空控制為：10PA±3，凍干時間為：10~15小時左右。解析干燥結束后凍干機自動進入保溫階段，出料前做壓力升測試，確保達到凍干效果，最后得到含水1%的中藥凍干物料，再通過低溫粉碎后得到中藥湯劑凍干粉。在整個真空冷凍干燥過程都是在低溫和真空環境下物理性除水，能有效保證物料不變異，不氧化，不產生化學反應確保中藥的藥理性。
真空凍干機機后將物料投入物料箱內進行冷凍.物料的冷凍過程，一方面是真空系統進行抽真空把一部分水份帶走；另一方面是物料受凍時把分子中所含水份排到物料的表面凍結，達到冷凍要求后，由加熱系統對物料加熱干燥，通過抽真空把物料中所含的水份帶到冷凍捕集箱結凍，達到物料冷凍干燥要求。
傳統的干燥會引起材料皺縮，破壞細胞。在冰凍干燥過程中樣品的結構不會被破壞，因為固體成份被在其位置上的堅冰支持著。在冰升華時，它會留下孔隙在干燥的剩余物質里。這樣就保留了產品的生物和化學結構及其活性的完整性。在實驗室中，凍干有很多不同的用途，它在許生物化學與制藥應用中是*的。它被用來獲得可長時期保存的生物材料，例如微生物培養、酶、血液、與藥品，除長期保存的穩定性外，還保留了其固有的生物活性與結構。為此，真空凍干機凍干被用于準備用做結構研究(例如電鏡研究)的組織樣品。冷凍干燥也應用于化學分析中，它能得到干燥態的樣品，或者濃縮樣品以增加分析敏感度。凍干使樣品成分穩定，也不需改變化學組成，是理想的分析輔助手段。冷凍干燥可以自然發生。在自然情況下，這一過程緩慢而且不可預測。通過冷凍干燥系統，人們改進、細分了很多步驟，加速了這一過程。
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