包裝材料的不同，就決定了殺菌釜的具體結構，下面就來討論一下各種不同的包裝材料所對應的不同的殺菌釜結構形式。
軟包裝類產品：軟包裝類產品其外形可以跟隨著產品的外形而起伏變化，如果對軟包裝進行抽真空，包裝材料的外形將會緊貼著產品的外表面而呈現出物料的外表狀態。由于是抽真空包裝的產品，在殺菌過程中殺菌釜內的壓力可以處于高于循環水殺菌溫度時汽化壓力一定的數值。在這樣的前提條件下，采用定壓式殺菌模式就是較合適的選擇。而對于傳熱效果來說，產品全部浸泡在水中的狀態則是迅速、充分的。即軟包裝抽真空類產品，殺菌模式就是水浴式殺菌釜
玻璃瓶類包裝產品 玻璃瓶在殺菌過程中應注意環境溫度不能驟然變化，玻璃瓶是剛性的材料，通常采用高溫灌裝，使玻璃瓶產品在常溫狀態下包裝材料內的壓力低于大氣壓力，即呈現負壓狀態(負壓狀態的一個目的是為在食用前的儲運過程中，一旦瓶內物料出現變質菌的活動產生一些氣體而引起瓶內壓力升高，就會使凹陷的瓶蓋凸起，提醒消費者瓶內物料不能再予食用)。但是在高溫殺菌過程中，玻璃瓶內的壓力會升高，為防止瓶外的循環水通過瓶蓋密封處進入瓶內，瓶外的壓力不應高于瓶內壓力。按照這些特性，對于玻璃瓶類包裝產品來說，選取上淋水式殺菌模式是比較合適的。
鐵罐類包裝材料 這類包裝材料，看起來是鐵罐，但由于其規格尺寸比較大，其抗壓差能力是比較弱的，所以在殺菌過程中，殺菌釜內壓力的控制就需要嚴格地跟隨溫度的變化而進行調整，這樣就可以使鐵罐所承受的壓差被控制在可承受的范圍內。需要注意的一點是，在升溫階段與降溫階段對于同樣的溫度，所對應的壓力是要有所區別的。因為升溫階段是向產品內部傳遞熱量，罐體內的溫度低于殺菌釜內的溫度，則殺菌釜內需要的壓力就會低一些；而在降溫階段，產品內部的熱量是向外散發的，罐體內的溫度高于殺菌釜內的溫度，則殺菌釜內需要的壓力就會高一點，這一點是需要注意的。對于不同的產品規格、不同的內容物，所控制的壓力也是有所區別的，需要具體地一一設置。
塑料包裝 拉伸膜類包裝 這類產品的殺菌，仍然是需要嚴格地控制溫度變換過程中壓力的數值。因為盒子里面有一定的空氣，傳熱比較緩慢，所以加熱、降溫的過程中，溫度的變化不能過快，且凡是置于殺菌釜內的所有產品須盡可能在一個較小的溫度范圍內同步地升溫、降溫。這樣做的目的是使包裝材料基本不承受壓差，從而可以很好地保證包裝材料在整個殺菌過程中不會由于壓力的作用而產生變形。前面說過，要做到使殺菌釜內所有的產品都在一個較小的溫度范圍內同步地升溫、降溫，這就對殺菌釜的熱分布性能有較高的要求。
盒狀包裝 這類產品的殺菌，仍然是需要嚴格地控制溫度變換過程中壓力的數值。因為盒子里面有一定的空氣，傳熱比較緩慢，所以加熱、降溫的過程中，溫度的變化不能過快，且凡是置于殺菌釜內的所有產品須盡可能在一個較小的溫度范圍內同步地升溫、降溫。這樣做的目的是使包裝材料基本不承受壓差，從而可以很好地保證包裝材料在整個殺菌過程中不會由于壓力的作用而產生變形。前面說過，要做到使殺菌釜內所有的產品都在一個較小的溫度范圍內同步地升溫、降溫，這就對殺菌釜的熱分布性能有較高的要求。
杯狀包裝 碗狀類包裝 這類產品的殺菌，仍然是需要嚴格地控制溫度變換過程中壓力的數值。因為盒子里面有一定的空氣，傳熱比較緩慢，所以加熱、降溫的過程中，溫度的變化不能過快，且凡是置于殺菌釜內的所有產品須盡可能在一個較小的溫度范圍內同步地升溫、降溫。值得注意的一點是，如果包裝材料內的空氣含量較少，就可以不考慮產品被壓縮的問題，即可以加大殺菌釜內的反壓，從而在整個殺菌過程中使殺菌釜內始終處于一個壓力。因為包裝材料內的物料不可壓縮、且空氣含量又少，所以即使外界壓力較大也不會對包裝材料本身產生變形的影響。
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